Après deux voyages dans le passé qui lui ont permis de découvrir une partie de l'histoire de sa famille à l'île Maurice et en Angleterre, le jeune Jonathan, métis anglo-réunionnais, passe des vacances paisibles avec ses cousins dans son île natale. Un jour son petit voilier est brisé par une baleine et après plusieurs jours seul sur l'océan, il est finalement recueilli par des pirates ! Il a encore remonté le temps : il est revenu au début du 18e siècle et la France et l'Angleterre sont encore en guerre !
Les pirates l'emmènent à Libertalia, une république égalitaire qu'ils ont créée sur une île près de Madagascar. Il réussit à s'en échapper et se réfugie à Madagascar où il est engagé pour enseigner l'anglais et les bonnes manières au fils qu'ont eu ensemble le chef des pirates et une reine malgache.
Pour fuir une guerre entre tribus, il se retrouve sur un vaisseau qui est chargé d'emmener des esclaves à l'île Maurice. Pris dans une tempête, il sauve la vie d'un jeune esclave. C'était là le but de sa mission puisque ce garçon est l'un de ses ancêtres !
Il retrouve ses cousins à la Réunion au 21ème siècle et leur prouve qu'il a vraiment effectué ses voyages dans le temps !