Le commentaire de référence sur l'Évangile de Jean ! Sans doute l'ouvrage auquel Godet tenait le plus. Une anecdote rapportée par son fils Philippe dans sa biographie, raconte que Godet voyageant sur les côtes de Norvège, éprouva le désir de visiter un phare. Quelle ne fut pas sa surprise de trouver le gardien du phare, en train de lire son Saint Jean ! Voyons-y un signe emblématique des lumières précieuses que ces pages ont su apporter aux lecteurs chrétiens de toutes les conditions, de toutes les latitudes, et jusqu'à aujourd'hui. Cette compilation ThéoTeX réunit les trois tomes parus en 1902.